Biokatalyse

Prof. Dr. Nediljko Budisa

Prof. Dr.

Nediljko Budisa

FGL Strukturprofessur

nediljko.budisa@tu-berlin.de

+49 30 314-29721

+49 30 314-28829

Einrichtung Biokatalyse
Sekretariat L1
Gebäude L
Raum L 161
Adresse Müller-Breslau-Str. 10
10623 Berlin

Wissenschaftlicher Werdegang

2010 - bis dato
Professor und Lehrstuhlinhaber für Biokatalyse am Institut für Chemie der Technischen Universität Berlin.
2006 - 2010
Privatdozent für Biochemie und Biotechnologie im Fachbereich 'Chemical Protein Engineering' an der Technischen Universität München.
2005 - 2010
Nachwuchsgruppenleiter im Fachbereich Molekulare Biotechnologie am Max Planck Institut für Biochemie, Technischen Universität München.
2001 - 2005
Wissenschaftllicher Mitarbeiter und Gruppenleiter im Fachbereich 'Protein Engineering' am Max Planck Institut für Biochemie, Habilitation in Biochemie, Technische Universität München.
1999 - 2000
Beteiligung an der Gründung der Firma Proteros Biostructures GmbH
1997 - 1999
Postdoktorand der Abteilung für Strukturelle Forschung (R. Huber) am Max Planck Institut für Biochemie, Technische Universität München.
 
1993 - 1997
Erlangung der Doktorwürde mit summa cum laude unter Anleitung von Prof. Dr. R. Huber, am Max Planck Institut für Biochemie, Technische Universität München.
1989 - 1993
Studium der Molekularen Biologie und Molekularen Biophysik an der Universität in Zagreb.
1986 - 1990
Lehramtsstudium in den Fächern Chemie und Biologie an der Universität in Zagreb.

Forschungsinteressen und wissenschaftliche Leistungen

Größte Errungenschaft:
Einer der Gründer und Pionier im Forschungsbereich des "genetic code engineering".
Visionen:
Genomweite Neugestaltung des genetischen Codes als vielversprechendster Weg zur Änderung und Erweiterung der grundlegenden Chemie des Lebens (d.h., Erschaffung von synthetischem Leben).
Forschungsziel:
Experimentelle Änderung des genetischen Codes.
Wissenschaftliche Interessen:
Synthetische Biologie & Xenobiologie; Bioorthogonale Chemie und klassischer Genetik (Stamm-Engineering und Evolution); Entwicklung von Plattformen mit erweitertem genetischem Code; Herstellung maßgeschneiderter Peptide, Proteine und Proteome; De novo Protein- und Proteomedesign, durch die Verknüpfung von gerichteter Enzymevolution; metabolisches Engineering; Synthetische Chemie; Herstellung von genetisch kodierbaren Wirkstoffen und Biomaterialien.

Ehrungen, Auszeichnungen und Funktionen in wiss. Beiräten u. Beratergremien

2014: Einer der Gründer und führender Vertreter im Bereich der Xenobiologie.

2013: Gründer des ersten Berliner iGEM-Teams im Bereich der synthetischen Biologie. (Goldmedaille 2014)

2012: Mitglied im Redaktionsbeirat der SynBio-Fachzeitschrift „Symplectic Biology“2011Mitglied der ERA-Net ERASynBio Advisory Board.
           Mitglied der BBAW Arbeitsgruppe „Gentechnologiebericht” für Synthetische Biologie.
           Mitglied des COST Netzwerks.

2010: Mitglied des Steering Committee der Max-Planck-Gesellschaft für Synthetische Biologie.

2008: Mitglied der Arbeitsgruppe “Synthetic and Systems Biology” von DECHEMA, Frankfurt; Mitglied des strategischen Beratungsgremium (ab 2012).

2007: Mitglied des Exzellencluster CIPSM der Ludwig Maximilian Universität /Technischen Universität München (2007 – 2010).

2004: Gutachter und Berater für BMBF2004BioFuture-Nachwuchspreis des BMBF

2001: Prüfer des Graduiertenkollegs IMPRS am Max-Planck Institut für Biochemie, München.

2001: Gründer und Mitglied der Deutschen Gesellschaft für Proteomforschung1998„BioRegio"-Auszeichnung für Biotechnologie - Unternehmensgründung „Proteros Biostructures

Publikationen

2019

Diwo, C.; Budisa, N.
Alternative Biochemistries for Alien Life: Basic Concepts and Requirements for the Design of a Robust Biocontainment System in Genetic Isolation
Genes, 2019 (10) :e17
2019
Baumann, T.; Hauf, M.; Schildhauer, F.; Eberl, K.B.; Durkin, P.M.; Deniz, E.; Löffler, J.G.; Acevedo-Rocha, C.G.; Jaric, J.; Martins, B.M.; Dobbek, H.; Bredenbeck, J.; Budisa, N.
Site-Resolved Observation of Vibrational Energy Transfer Using a Genetically Encoded Ultrafast Heater
Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 58 (9) :2899-2903
2019
Kubyshkin, V.; Budisa, N.
Anticipating alien cells with alternative genetic codes: away from the alanine world!
Curr. Opin. Biotechnol., 2019 (60) :242-249
2019
Gerrits, M.; Merk, H.; Budisa, N.
Site-Specific Chemoselective Pyrrolysine Analogues Incorporation Using the Cell-Free Protein Synthesis System
ACS Synth. Biol., 2019 (8(2)) :381-390
2019
Schneider, T.; Gavrilova, I.; Budisa, N.
Synthesis of a new metal chelating amino acid: Terpyridyl-alanine
Tetrahedron Lett., 2018 (18) :2053-2063
2019
Kubyshkin, V.; Budisa, N.
Promotion of the collagen triple helix in a hydrophobic environment
Org. Biomol. Chem., 17 (19) :2502-2507
2019
Nojoumi, S.; Ying, M.; Schwagerus, S.; Hackenberger, C.P.R.; Budisa, N.
In-Cell Synthesis of Bioorthogonal Alkene Tag S-Allyl-Homocysteine and Its Coupling with Reprogrammed Translation
Int. J. Mol. Sci., 20(9= (e2299)
2019
Schneider, T.; Budisa, N.
Expanding the DOPA Universe with Genetically Encoded, Mussel-Inspired Bioadhesives for Material Sciences and Medicine
ChemBioChem, 2019 (Mar 4. Epub)
2019
Baumann, T.; Hauf, M.; Richter, F.; Albers, S.; Möglich, A.; Ignatova, Z.; Budisa, N.
Computational Aminoacyl-tRNA Synthetase Library Design for Photocaged Tyrosine
Int. J. Mol. Sci., 20 (9) :e2343
2019

2018

Budisa, N.; Fehse, B.; Müller-Röber, B.; Reich, J.; Walter, J.
Looking back and forth: Development and current challenges in various core areas of genetic engineering
Accounting for a High Technology - Fourth Genetic Technology Report of Interdisciplinary Research Group of the Berlin-Brandenburg Academy of Sciences and Humanities, 2018 :203-236
2018
Herausgeber: Nomos Verlag
ISSN: 978-3-8452-9379-0
ISBN
978-3-8487-5183-9
Kubyshkin, V.; Grage, S. L.; Bürck, J.; Ulrich, A. S.; Budisa, N.
Transmembrane Polyproline Helix
J. Phys. Chem. Lett, 9 :2170-2174
2018

Synthetic biology – metabolic engineering
In Zhao, Huimin and Zeng, A.-P, Editor, Band 162 aus Advances in biochemical engineering/biotechnology
Herausgeber: Springer, Cham, Switzerland
2018
ISBN
9783319553184
Schneider, T.; Kubyshkin, V.; Budisa, N.
Synthesis of a Photo‐Caged DOPA Derivative by Selective Alkylation of 3, 4‐Dihydroxybenzaldehyde
Eur. J. Org. Chem., 2018(18) :2053-2063
2018
Ma, Y.; Salvo, M. L.; Budisa, N.
Self-Directed in Cell Production of Methionine Analogue Azidohomoalanine by Synthetic Metabolism and Its Incorporation into Model Proteins
Methods. Mol. Biol., 1728 :127-135
2018
Stempel, E.; Kaml, R. F.; Budisa, N.; Kalesse, M.
Painting argyrins blue: Negishi cross-coupling for synthesis of deep-blue tryptophan analogue β-(1-azulenyl)-l alanine and its incorporation into argyrin C
Bioorg. Med. Chem.
2018
Baumann, Tobias; Exner, Matthias; Budisa, Nediljko
Orthogonal Protein Translation Using Pyrrolysyl-tRNA Synthetases for Single- and Multiple-Noncanonical Amino Acid Mutagenesis
Advances in biochemical engineering/biotechnology, 162 :1–19
2018
ISSN: 0724-6145
Kubyshkin, Vladimir; Acevedo-Rocha, Carlos G.; Budisa, Nediljko
On universal coding events in protein biogenesis
Biosystems, 164 :16–25
2018
ISSN: 0303-2647
Schmidt, Markus; Pei, Lei; Budisa, Nediljko
Xenobiology: State-of-the-Art, Ethics, and Philosophy of New-to-Nature Organisms
Advances in biochemical engineering/biotechnology, 162 :301–315
2018
ISSN: 0724-6145
Biava, H.; Schreiber, T.; Katz, S.; Völler, J-S.; Stolarski, M.; Schulz, C.; Michael, N.; Budisa, N.; Kozuch, J.; Tillmann, U.; Hildebrandt, P.
Long-Range Modulations of Electric Fields in Proteins
J. Phys. Chem. B, B122 (35) :8330-8342
2018
Serikawa ; Spanos ; Hacht ; Budisa ; Rappsilber, J.; J., Kurreck
Comprehensive identification of proteins binding to RNA G-quadruplex motifs in the 5' UTR of tumor-associated mRNAs
Biochimie (144) :169-184
2018
Nickling, J. H.; Baumann, T.; Schmitt, F. J.; Bartholomae, M.; Kuipers, O. P.; Friedrich, T.; Budisa, N.
Antimicrobial Peptides Produced by Selective Pressure Incorporation of Non-canonical Amino Acids
J. Vis. Exp., e57551(135)
2018
Kubyshkin, V.; Pridma, S.; Budisa, N.
Comparative effects of trifluoromethyl-and methyl-group substitutions in proline
New. J. Chem., 2018 (42) :13461-13470
2018
Kubyshkin, V.; Budisa, N.
Exploring hydrophobicity limits of polyproline helix with oligomeric octahydroindole‐2‐carboxylic acid
J. Pept. Sci., 4-5 (24) :e3076
2018
Serikawa, T.; Spanos, C.; vonHacht, A.; Budisa, N.; Rappsilber, J.; Kurreck, J.
Comprehensive identification of proteins binding to RNA G-quadruplex motifs in the 5′ UTR of tumor-associated mRNAs
Biochimie (144) :169-184
2018
Serikawa, T.; Spanos, C.; vonHacht, A.; Budisa, N.; Rappsilber, J.; Kurreck, J.
Comprehensive identification of proteins binding to RNA G-quadruplex motifs in the 5′ UTR of tumor-associated mRNAs
Biochimie, 2018 (144) :169-184
2018

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Bücher

2006

Budisa, Nediljko
Engineering the genetic code: Expanding the amino acid repertoire for the design of novel proteins
Herausgeber: Wiley-VCH, Weinheim
2006
ISBN
3527312439

Patente

2021

Hauf, Matthias; Budisa, Nediljko; Richter, Florian; Baumann, Tobias; Schneider, Tobias
Modified Mussel Proteins, Uses Thereof and Related Compounds
2021

2012

Budisa, Nediljko; Wiltschi, Birgit; Royter, Marina; Antranikian, Garabed; Grote, Ralf
Lipase congeners with enhanced substrate access
2012

2009

Budisa, Nediljko; Merkel, Lars; Cheburkin, Yuri; Ullrich, Axel; Knyazev, Piotr; Wiltschi, Birgit
Method for the production of proteins with chemically functionalized N-termini
2009

2004

Budisa, Nediljko; Rubini, Marina; Huber, Robert; Knyazev, Peter; Ullrich, Axel; Neuefeind, Torsten
Composition containing peptide that includes amino acid analog, useful for treating e.g. cancer, where the peptide binds to and enters only specific target cells
2004

2002

Huber, Robert; Budisa, Nediljko; Moroder, Luis; Alefelder, Stefan; Bae, Jae Hyun; Kaiser, Jens; Freye, Minks Caroline; Neuefeind, Torsten
Tryptophan analogs in proteins, peptides and peptidic structures
2002
Huber, Robert; Budisa, Nediljko; Moroder, Luis; Alefelder, Stefan; Bae, Jae Hyun; Kaiser, Jens; Freye, Minks Caroline; Neuefeind, Torsten
Tryptophan-Analoga in Proteinen, Peptiden und peptidischen Leitstrukturen
2002

1998

Nediljko, Budisa; Robert, Huber; Carolin, Minks; Luis, Moroder
Incorporation of pharmacologically active amino acid analogues into proteins
1998
Budisa, Nediljko 82152 Planegg; Huber, Robert 82110 Germering; Minks, Carolin 82110 Germering; Moroder, Luis 82152 Planegg
Inkorporation von pharmakologisch wirksamen Aminosäureanaloga in Proteine
1998